Système d'information de laboratoire – Boîte à outils d'intégration DHIS2

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Le Centre HISP de l’Université d’Oslo, avec le soutien du CDC américain, a publié une boîte à outils destinée à l’intégration des systèmes d’information de laboratoire à DHIS2.

Le problème auquel elle répond. Les programmes de suivi utilisés pour la surveillance des maladies par cas ont régulièrement besoin des résultats de laboratoire. L’envoi électronique de ces résultats, plutôt que leur saisie manuelle, accélère la prise de décision, élimine les erreurs de transcription entre les systèmes et permet au personnel de santé et aux responsables de disposer plus rapidement des informations.

Contenu de la boîte à outils. Des conseils sur les modèles et les normes d’intégration concernés, ainsi qu’une implémentation de référence fonctionnelle que vous pouvez exécuter localement avec Docker. L’implémentation de référence importe les résultats de laboratoire depuis un SIL vers un programme Tracker de DHIS2 en récupérant les rapports de diagnostic à partir d’un SIL simulé conforme au guide d’implémentation FHIR des rapports de laboratoire HL7, en les transformant en événements Tracker, puis en les transmettant à l’API Web de DHIS2. Une couche d’interopérabilité (IOL) assure la médiation de l’échange et comble les différences structurelles et sémantiques entre FHIR et DHIS2.

Fonctionnement pratique :

  • Le cas est enregistré dans un programme de surveillance des cas ; une étape de demande d’analyse enregistre l’identifiant de l’échantillon, qui sert de clé de liaison entre le cas DHIS2 et le rapport du LIS
  • Lorsqu’un rapport correspondant devient disponible dans le LIS, l’étape « Résultat de laboratoire » est automatiquement renseignée sans intervention humaine, laissant un formulaire rempli à l’intention du responsable de la surveillance
  • Le mappage terminologique réside au sein même de DHIS2 : les éléments de données et les valeurs des ensembles d’options sont liés aux codes LOINC par le biais d’attributs ; ainsi, un développeur peut modifier les mappages LOINC-DHIS2 directement dans DHIS2 sans faire appel à l’équipe chargée de la maintenance de l’IOL
  • Le script de transformation FHIR vers DHIS2 est également stocké dans la base de données DHIS2

Ce document est conçu comme un guide technique pour développer votre propre intégration LIS-DHIS2 et ne doit pas être utilisé directement en production sans l’adapter à votre contexte local.

Ressources

Ce travail a été réalisé avec le soutien du CDC américain, dans le cadre de notre collaboration de longue date visant à renforcer la surveillance et la réponse aux maladies.